Desde la apertura de este recinto museístico, se han podido conformar diversas colecciones a partir de las donaciones, comodatos y préstamos.

El Museo Regional de Historia cuenta con un acervo que abarca desde fotografías en blanco y negro y color, hasta placas de colodión y un daguerrotipo; el objeto más antiguo data de la década de 1830 y las fotografías más contemporáneas son de la década de 1960.

Se cuenta con una colección de textiles de los siglos XIX y XX. En este sentido, el museo tiene algunas prendas femeninas y masculinas, dechados y encajes que reflejan la bonanza de la industria textil en Aguascalientes.

La mayor parte de los restos óseos que se encuentran en este acervo pertenecen a la época del Pleistoceno y casi en su totalidad fueron encontrados en la región de Aguascalientes y Jalisco.

En 1987, con el objetivo de abrir un museo que narrara y exhibiera la historia del estado y, con la suma de voluntades y la sociedad civil, se creó el Museo Regional de Historia.

En el centro histórico de la ciudad de Aguascalientes, en una de las casas más emblemáticas y bellas del arquitecto Refugio Reyes, se encuentra el Museo Regional de Historia. Aquí se salvaguarda la memoria diversa de Aguascalientes, desde el Pleistoceno hasta las primeras décadas del siglo XX.